Expression of α-Cyclodextrin Glycosyltransferase Gene of Gebacillius sp. CHB1 in Bacillus subtilis
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摘要:目的 构建分泌表达α-环糊精葡萄糖基转移酶(α-CGTase)的重组枯草芽胞杆菌,实现α-CGTase的安全高效表达。方法 通过PCR法扩增嗜热地芽胞杆菌α-CGTase基因,运用EcoR Ⅰ/Xho Ⅰ分别对α-CGTase基因及pBES进行双酶切,然后将该基因片段插入到大肠杆菌-枯草芽胞杆菌穿梭载体pBES中,再电转化法转化枯草芽胞杆菌RIK1285;对重组枯草芽胞杆菌B.subtilis RIK1285/pBE-CGT发酵条件进行探索。结果 (1)利用发酵培养基分泌表达α-CGTase,重组枯草芽胞杆菌工程菌B.subtilis RIK1285/pBE-CGT发酵上清液产酶达到2.9 U·mL-1。(2)TB为最适发酵培养基(配方:甘油0.5%,蛋白胨1.2%,酵母粉2.4%,K2HPO4 1.64%,KH2PO4 0.23%);在初始pH 6.5,温度为37℃下,摇瓶发酵培养24 h后,α-环糊精酶的环化活性达到5.3 U·mL-1,是野生菌株嗜热地芽胞杆菌(0.66 U·mL-1)的8倍。结论 成功构建了枯草芽胞杆菌B.subtilis RIK1285/pBE-CGT工程菌,并确定其最适发酵培养基和培养条件。
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关键词:
- 枯草杆菌工程菌 /
- α-环糊精葡萄糖基转移酶 /
- 表达 /
- 优化
Abstract:Objective To construct a vector for expressing α-cyclodextrin glycosyltransferase (α-CGTase) gene in Bacillus subtilis.Method The α-CGTase gene from Gebacillius sp. CHB1 was amplified by PCR. The EcoR Ⅰ-digested pBES and Xho Ⅰ-digested α-CGT gene were connected and transformed into B. subtilis RIK1285. Subsequently, fermentation of the recombinant B. subtilis RIK1285/pBE-CGT was optimized.Result (1) The α-CGTase gene was expressed in a fermentation medium to show an enzymatic activity of 2.9 U·mL-1 by B. subtilis RIK1285/pBE-CGT. (2) Medium TB with the formula of 0.5% glycerol, 1.2% peptone, 2.4% yeast extract, 1.64% K2HPO4, and 0.23% KH2PO4 was found to be optimal for the fermentation. After fermentation in TB at 37℃ for 24h, the α-CGTase activity reached 5.3 U·mL-1, which was 8-fold of what the wild Gebacillius sp. CHB1 could generate.Conclusion The engineered B. subtilis RIK1285/pBE-CGT was successfully obtained and the fermentation process optimized. -
0. 引言
【研究意义】环糊精是生物酶催化淀粉等相关基质经环化形成的环状寡聚糖,由6个以上葡萄糖通过α-1,4-糖苷键联结而成,通常由6、7、8个D-吡喃葡萄糖单元构成,称为α-、β-、γ-环糊精。由于环糊精分子具有特殊的外表亲水、内里疏水的中空圆筒结构,能与许多客体分子形成包络物,进而改变客体分子的溶解度、稳定性等物理化学性质,在农药、食品、医药、化妆品和环保等领域具有广泛的应用[1]。环糊精糖基转移酶(cyclodextrin glycosyltransferase, 简称CGTase)是生产环糊精的重要工业用酶,鉴于环糊精的巨大应用价值,生产环糊精所必需的CGTase的制备成为了当今研究的热点。环糊精酶催化产物通常包含α-、β-、γ-环糊精3种环糊精,根据主要产物的不同,将环糊精酶分类为α-、β-、γ-环糊精酶。总结现有的报道,环糊精酶的获取方式大致归纳为3种:从自然界中筛选野生菌株;根据基因文库进行克隆表达;对已知目的基因片段进行蛋白质工程改良。其中野生菌株筛选不仅最为直接有效,而且也是后两种方式的基础[2]。有关CGT酶的研究已经跨越了一个世纪,人们对环糊精酶也逐步提出了更高的要求:更高的产物专一性、更高的热稳定性、更稳定的耐碱性,甚至更强的抗有机试剂性能。【前人研究进展】为了降低环糊精生产成本,提高CGTase的产量和催化特性, 将CGTase基因采用基因工程方法进行异源表达被认为是最有效的途径之一。目前常见的基因表达系统主要有大肠杆菌、芽胞杆菌及酵母表达系统。其中大肠杆菌表达环糊精酶多有报道[3-5],酵母表达系统报道较少[6-7],并且效果不甚理想。而枯草芽胞杆菌表达系统,与其他表达系统相比具有明显的优势:首先,相对于大肠杆菌表达系统:枯草芽胞杆菌为非致病性、细胞壁组成简单、重组表达的蛋白内毒素低、较低密码子偏爱性、表达蛋白可溶性高、生物活性好[8-9]。其次,相对于真核表达系统,其表达周期短,成本低,表达量较高。【本研究切入点】本课题组在前期工作中从Gebacillius sp.CHB1中分离获得了1种α-环糊精酶,该酶最适反应温度达到65℃,有较好的热稳定性,应用潜力巨大,并且该CGT基因在大肠杆菌 E. coli及毕赤酵母中成功克隆表达[10-12]。大肠杆菌表达量虽高,但易形成包涵体,对环糊精酶的分离造成困难,而毕赤酵母表达量较低。【拟解决的关键问题】本研究尝试选用枯草芽胞杆菌分泌表达系统表达嗜热芽胞杆菌CHB1 α-CGTase,以期实现α-CGTase的安全高效表达,并对该工程菌的发酵温度、pH和培养基等进行优化,为环糊精酶工程菌株的规模化生产奠定基础。
1. 材料与方法
1.1 菌种和质粒
嗜热芽孢杆菌Gebacillius sp.CHB1(含新型环糊精酶基因)、大肠杆菌Escherichia coli JM109为福建省农业科学院土壤肥料研究所保存;枯草芽胞杆菌B. subtilis strain RIK1285、大肠杆菌E. coli穿梭载体pBE-S DNA购自大连宝生物工程(TaKaRa)公司。
1.2 试剂与仪器
限制性内切酶、Taq DNA聚合酶、DNA Mark、T4DNA连接酶及B. subtilis strain RIK1285感受态细胞购自TaKaRa公司;DNA切胶回收试剂盒、PCR引物及质粒快速提取试剂盒购自上海生工生物工程股份有限公司,其余试剂均为国产或进口分析纯。3-18K超高速冷冻离心机购自Sigma公司,PCR仪购自基因有限公司,Multiskan FC酶标仪购自美国Thermo公司。
1.3 培养基
LB培养基,Amp终浓度100 μg·mL-1。TSB(胰蛋白胨大豆肉汤培养基):胰蛋白胨1.5%,大豆蛋白胨0.5%,氯化钠0.5%。M9:葡萄糖1%,维生素B1(单独灭菌) 1 μg·mL-1,Na2HPO4 1.28%,KH2PO4 0.3%, NaCl 0.05%,NH4Cl 0.5%。TB:甘油0.5%,蛋白胨1.2%,酵母粉2.4%,K2HPO4 1.64%,KH2PO4 0.23%。
1.4 α-环糊精酶基因引物设计与扩增
提取嗜热芽胞杆菌Gebacillius sp. CHB1基因组DNA, 并以此为模板,在α-环糊精酶基因上下游分别添加限制性酶切位点(Xho Ⅰ和EcoR Ⅰ),设计上下游引物如下:
CGT-F:5′-CCG CTC GAGA ATA AGG TAA ATT TTA CAT CG-3′(下划线为Xho Ⅰ限制性酶切位点);CGT-R:5′-CCG GAA TTC GTT TTG CCA ATT CAC TAT AAT-3′(下划线为EcoR Ⅰ限制性酶切位点);用PCR扩增试剂盒进行α-CGT酶基因扩增。PCR反应条件:94℃ 4 min;94℃ 60 s,58℃ 45 s,72℃ 2 min,循环30次;72℃ 10 min。DNA切胶回收试剂盒进行CGT片段回收,备用。
1.5 重组表达质粒pBE-CGT的构建及鉴定
用限制性内切酶EcoR Ⅰ和Xho Ⅰ分别对pBE载体及CGT片段进行双酶切,胶回收CGT基因片段及pBE线性载体;参照TaKaRa公司T4 DNA连接酶使用说明书,将CGT基因片段与pBES线性载体混合,进行连接反应,连接产物转化感受态细胞JM109,经100 μg·mL-1氨苄青霉素抗性LB平板及菌落PCR鉴定,构建重组枯草芽胞-大肠杆菌穿梭表达质粒pBE-CGT;同时提取相应质粒送至上海生工生物工程有限公司测序验证。
1.6 重组芽胞杆菌的构建及筛选
采用电转化方法,冰浴融化感受态细胞枯草芽胞杆菌B. subtilis strain RIK1285,与3 μL重组表达质粒pBE-CGT混匀,设置电转化参数(电击参数1 500 V、25 μF、200 Ω),将pBE-CGT载体导入感受态B. subtilis strain RIK1285中,于100 μg·mL-1氨苄青霉素抗性LB平板培养至转化子出现(24~48 h),挑取若干克隆子进行PCR验证,获得重组枯草芽胞杆菌重组B. subtilis RIK1285/pBE-CGT。
1.7 枯草芽胞杆菌的发酵培养
种子液培养:挑取重组枯草芽胞杆菌B. subtilis单克隆于LB培养基生长18 h;
发酵培养:按1%接种量将种子发酵液接种至50 mL发酵培养基,在37℃摇床培养36 h,每隔一段时间取样,将发酵液于12 000 r·min-1离心2 min除菌体,收集上清液,测定α-环糊精酶活性。
1.8 重组枯草杆菌表达外源蛋白条件优化
1.8.1 培养时间对产酶的影响
为考察重组枯草芽胞杆菌发酵不同阶段α-环糊精酶活性变化,在温度37℃、pH7.0条件下,进行工程菌产酶培养,每隔4 h进行取样测定OD600和环糊精酶活力,发酵持续32 h。
1.8.2 培养温度对产酶的影响
为考察不同温度对重组枯草芽胞杆菌产环糊精酶能力的影响,在pH7.0条件下分别采用25℃、30℃、37℃、40℃培养,24 h后测定OD600和环糊精酶活力。
1.8.3 初始pH对产酶的影响
为考察不同初始pH对重组枯草芽胞杆菌产环糊精酶能力的影响,在温度37℃下,调整初始发酵pH分别为5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0,经过发酵24 h后,测定OD600和环糊精酶活力,考察初始pH对环糊精酶表达量的影响。
1.8.4 初始培养基对产酶的影响
为考察不同初始培养基对重组枯草芽胞杆菌重组B. subtilis RIK1285/pBE-CGT产环糊精酶能力的影响,在温度37℃、pH6.5条件下,分别对常用芽胞杆菌培养基(LB,TSB,M9,TB),进行发酵培养24 h,筛选最适培养基。
1.9 CGTase酶活性测定
测定α-环糊精葡萄糖基转移酶活力的方法参照甲基橙褪色法[13],具体操作如下:取0.9 mL预先用50 mmol·L-1磷酸钠缓冲液(pH6.0)配制的3%(w/v)可溶性淀粉溶液于试管中,置于60℃水浴锅内预热2 min,然后加入粗酶液或适当稀释的纯酶液0.1 mL,反应10 min,立即加入1.0 mL 1 mol·L-1的盐酸终止反应,再加入1.0 mL(pH6.0)的0.1 mmol·L-1的甲基橙溶液,混匀后于16℃下保温20 min,用酶标仪测定波长505 nm处的吸光度并根据空白计算褪色程度(ΔA),最后根据α-环糊精标准曲线计算出α-环糊精的浓度。酶活性单位定义为:60℃,pH6.0下,每分钟催化产生1 μmol α-环糊精所需的酶量即为一个酶活力单位(U)。
2. 结果与分析
2.1 CGTase表达质粒的构建
以EcoR Ⅰ和Xho Ⅰ为双酶切体系,分别对载体pBE载体及CGT片段进行双酶切,回收2 000 bp(CGT)及6 000 bp线性载体pBE。转化大肠杆菌JM109,筛选阳性克隆子,提质粒进行单/双酶切验证,电泳结果如图 1所示,在2、6及8 kb附近出现2条预期大小的DNA亮带,说明大肠杆菌/芽胞杆菌穿梭表达质粒pBE-CGT成功构建。进一步通过电转化法将梭表达质粒pBE-CGT导入B. subtilis RIK1285感受态细胞,筛选克隆子菌落进行PCR验证(引物CGT-F/CGT-R)(图 2),在2 kb左右出现预期大小条带;同时将质粒送上海生工进行测序验证,由测序结果可知,环糊精酶重组枯草芽胞杆菌工程菌B. subtilis RIK1285/pBE-CGT构建完成。
2.2 重组枯草芽胞杆菌产环糊精酶
以基础培养基LB为发酵培养基,对工程枯草芽胞杆菌菌B. subtilis RIK1285/pBE-CGT进行产酶培养,每隔4 h测定芽胞杆菌生长情况及产酶量,结果如图 3所示。随着发酵时间延长,细胞密度及酶活力均出现逐步上升的趋势,发酵16 h细胞量趋于稳定,菌体生长进入稳定期,当发酵24 h后,菌体浓度开始下降,此时α-环糊精酶酶活力达到最大值2.9 U·mL-1,之后伴随菌体进入衰亡期,酶活力略微下降。因此,发酵24 h为该工程菌的最适发酵时间。
2.3 重组枯草杆菌发酵环糊精酶条件优化
2.3.1 培养温度对产环糊精酶的影响
温度对微生物生长及生物酶活性具有重要影响;温度的改变,影响着微生物的代谢活动,过低的温度可能使微生物生长停滞,过高的温度可能导致微生物致死,因此本试验考察了4个温度下,工程菌经24 h发酵后的产酶情况,结果如表 1所示。随着温度的升高,菌体逐渐升高,生长旺盛;然而环糊精酶活性随温度的升高,呈先上升后下降的趋势,在37℃下酶活性达到最大值,为最适表达温度。分析原因,可能由于温度过低,菌体生长缓慢酶表达量低;随温度升高,菌体产酶速度加快,过高导致酶活降低,可能高温产生更多的蛋白酶对环糊精酶产生降解。
表 1 不同温度对菌体生长和产酶的影响Table 1. Effects of temperature on growth and enzyme production of bacteria温度
Temperature/℃细胞密度
OD600环糊精酶活性
CGTase activity/(U·mL-1)25 6.9 1.6±0.11a 30 7.3 2.1±0.16b 37 8.3 2.9±0.14c 40 9.5 1.9±0.15b 注:同列数据后不同小写字母表示不同处理间差异显著(P<0.05)。表 2~3同。
Note:Values are the means±SD(n=3).Means with different letters within the same column are signi cantly different (P<0.05).The same as Table 2-3.表 2 不同pH对菌体生长和产酶的影响Table 2. Effects of pH on growth and enzyme production of bacteria酸碱度
pH细胞密度
OD600环糊精酶活性
CGTase activity/(U·mL-1)5.5 7.3 1.9±0.13a 6.0 7.9 2.7±0.17b 6.5 8.1 3.3±0.19c 7.0 8.3 3.0±0.15c 7.5 8.4 2.7±0.15b 8.0 8.1 2.1±0.12a 表 3 不同培养基对产环糊精酶的影响Table 3. Effects of culture medium on growth and enzyme production of bacteria初始培养基
Initial medium细胞密度
OD600环糊精酶活性
CGTase activity/(U·mL-1)LB 8.3 2.9±0.17a TSB 9.2 3.5±0.16b M9 10.5 4.1±0.13c TB 12.3 5.3±0.21d 2.3.2 pH对产环糊精酶的影响
pH是影响微生物生长及工程菌发酵过程中各种酶活性的一个重要因素,因此,本研究分析了不同pH下,工程菌经24 h发酵后的产酶情况,结果如表 2所示。当控制初始pH在6.0-8.0时菌体生长旺盛,pH7.5时菌体量最高;而在pH 6.5时酶活力达到最高,说明中性偏碱性有利于菌体生长,而中性偏酸性环境有利于外源环糊精酶基因的表达。因此,虽然初始pH在7.5时更有利于菌体生长,但工程菌最适表达pH为6.5。
2.3.3 不同培养基对产环糊精酶的影响
为了选择适合工程菌表达α-CGT酶并可用于下步优化的出发培养基, 将工程菌置于4种常见的枯草芽胞杆菌培养基中培养24 h,测定细胞密度及相应环糊精酶活力(表 3)。由表 3可知,经TB培养基发酵后,工程菌的细胞密度及环糊精酶活力均最高,明显高于其他3种培养基,究其原因:相对LB、TSB培养基而言,TB培养基有相对较高的pH缓冲能力,稳定的pH环境更有利于菌体生长,表达更多蛋白。相对M9而言,TB含丰富的营养成分(蛋白胨、甘油等)更适合菌体生长,因此有更多的菌体生产重组环糊精酶,更有利于α-CGT酶的表达。因此最终确定TB为最优发酵培养基。在pH6.5、37℃下,进行工程菌B. subtilis RIK1285/pBE-CGT产α-环糊精酶培养,其菌体生长及产酶曲线如图 4所示,在发酵24 h胞外酶活达到最高,为5.3 U·mL-1,细胞密度达到(OD600)12.3。
3. 讨论与结论
环糊精分子因其特殊的环状中空结构,具有的很强包络能力,应用广泛。随着人类生活品质的提高,对环糊精的需求量日益增长。环糊精的工业化生产主要是有环糊精酶催化合成。因此环糊精酶的产量及活性对环糊精的生产至关重要。随着现代分子生物学的飞速发展,运用基因工程手段,实现CGTase基因的异源超量表达,成为国内外研究的热点。本课题组前期已经实现了环糊精酶在大肠杆菌与酵母中的表达,取得一定进展。
为进一步提高环糊精酶表达量,探索环糊精酶最适表达系统,本研究选择枯草芽胞杆菌表达系统,成功构建了枯草芽胞杆菌B. subtilis RIK1285/pBE-CGT工程菌,并对工程菌发酵培养基种类及基础发酵条件进行了初步探索,最终确定TB为该工程菌的最适发酵培养基,在初始pH 6.5、37℃下,持续发酵24 h后,细胞密度达到12.3(OD600),此时测得发酵上清液α-环糊精酶环化活力同时达到最大值5.3 U·mL-1,是野生菌Gebacillius sp.CHB1产α-环糊精酶(0.66 U·mL-1)的8倍[14]。目前有关α-环糊精酶的异源表达,主要集中在大肠杆菌表达系统,而枯草芽胞杆菌表达系统鲜见报道,张佳瑜等[7]研究来源于软化芽孢杆菌的α-环糊精葡萄糖基转移酶在枯草杆菌中的表达,表达量是野生菌株软化芽孢杆菌表达量的9.8倍,α-环糊精酶活力为4.9 U·mL-1。本研究结果虽最终提高倍数略低于前者,但最终酶活力更高。另外,虽然本研究枯草芽胞杆菌α-环糊精酶表达量低于其在大肠杆菌中的表达量,但相对大肠杆菌表达系统而言,枯草芽胞杆菌遗传背景清晰,属于公认的食品工业安全菌,不含内毒素,具有良好的遗传稳定性,且分离纯化工艺简单,是环糊精酶乃至其他酶蛋白高效表达、最终实现规模化生产的重要途径。后期深入研究,将考虑通过信号肽、表达载体等的优化以及对酶分子的氨基酸序列进行定点突变,最大限度提高环糊精酶在枯草芽胞杆菌中的表达量,为其规模化生产提供技术支持。
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表 1 不同温度对菌体生长和产酶的影响
Table 1 Effects of temperature on growth and enzyme production of bacteria
温度
Temperature/℃细胞密度
OD600环糊精酶活性
CGTase activity/(U·mL-1)25 6.9 1.6±0.11a 30 7.3 2.1±0.16b 37 8.3 2.9±0.14c 40 9.5 1.9±0.15b 注:同列数据后不同小写字母表示不同处理间差异显著(P<0.05)。表 2~3同。
Note:Values are the means±SD(n=3).Means with different letters within the same column are signi cantly different (P<0.05).The same as Table 2-3.表 2 不同pH对菌体生长和产酶的影响
Table 2 Effects of pH on growth and enzyme production of bacteria
酸碱度
pH细胞密度
OD600环糊精酶活性
CGTase activity/(U·mL-1)5.5 7.3 1.9±0.13a 6.0 7.9 2.7±0.17b 6.5 8.1 3.3±0.19c 7.0 8.3 3.0±0.15c 7.5 8.4 2.7±0.15b 8.0 8.1 2.1±0.12a 表 3 不同培养基对产环糊精酶的影响
Table 3 Effects of culture medium on growth and enzyme production of bacteria
初始培养基
Initial medium细胞密度
OD600环糊精酶活性
CGTase activity/(U·mL-1)LB 8.3 2.9±0.17a TSB 9.2 3.5±0.16b M9 10.5 4.1±0.13c TB 12.3 5.3±0.21d -
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