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基于SRAP分子标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析

林榕燕 叶秀仙 钟淮钦 林兵 黄敏玲

林榕燕, 叶秀仙, 钟淮钦, 林兵, 黄敏玲. 基于SRAP分子标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析[J]. 福建农业学报, 2018, 33(5): 469-473. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.05.004
引用本文: 林榕燕, 叶秀仙, 钟淮钦, 林兵, 黄敏玲. 基于SRAP分子标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析[J]. 福建农业学报, 2018, 33(5): 469-473. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.05.004
LIN Rong-yan, YE Xiu-xian, ZHONG Huai-qin, LIN Bing, HUANG Min-ling. Genetic Diversity of Dendrobium Germplasms Accessed by SRAP Markers[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2018, 33(5): 469-473. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.05.004
Citation: LIN Rong-yan, YE Xiu-xian, ZHONG Huai-qin, LIN Bing, HUANG Min-ling. Genetic Diversity of Dendrobium Germplasms Accessed by SRAP Markers[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2018, 33(5): 469-473. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.05.004

基于SRAP分子标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.05.004
基金项目: 

福建省科技计划项目——省属公益类科研院所基本科研专项 2015R1026-8

福建省财政专项——福建省农业科学院科技创新团队建设项目 STIT2017-2-9

福建省农业科学院青年开放基金项目 2015QN-4

福建省农业科学院科技创新团队PI项目 2016PI-39

详细信息
    作者简介:

    林榕燕(1990-), 女, 研究实习员, 主要从事花卉生物技术研究(E-mail:lryyan@163.com)

    通讯作者:

    黄敏玲(1960-), 女, 研究员, 主要从事花卉品种选育与生物技术研究(E-mail:huangml618@163.com)

  • 中图分类号: S682.31

Genetic Diversity of Dendrobium Germplasms Accessed by SRAP Markers

  • 摘要: 为合理利用石斛兰种质资源,用SRAP分子标记技术对48份石斛兰种质资源的遗传多样性进行分析。结果显示:筛选得到的14对石斛兰SRAP引物共扩增出159个条带,其中多态性条带数为155个,各引物的多态性比率为90.00%~100.00%,多态性信息含量为0.718~0.903,表明石斛兰SRAP的多态性信息含量较为丰富。聚类分析结果发现48个石斛兰品种间的遗传距离在0.15~0.97,在遗传距离为0.83处可将48个石斛兰品种分为7大聚类群,说明供试的石斛兰品种间具有十分丰富的遗传多样性。
  • 图  1  引物Me1+Em8在48个石斛兰品种中的扩增

    Figure  1.  Amplified Me1+Em8 primers of 48 Dendrobium cultivars

    图  2  48份石斛兰品种聚类分析

    Figure  2.  Cluster profile of 48 Dendrobium cultivars

    表  1  供试材料

    Table  1.   Materials tested

    编号 品种名
    1 鼓槌石斛
    2 流苏石斛
    3 铁皮石斛
    4 铜皮石斛
    5 金钗石斛
    6 秋石斛D46
    7 晶帽石斛
    8 蜂腰石斛
    9 玫瑰石斛
    10 球花石斛
    11 长苏石斛
    12 秋石斛D2015129
    13 肿节石斛
    14 黄喉石斛
    15 黄橙石斛
    16 曲轴石斛
    17 檀香石斛
    18 血喉石斛
    19 麝香石斛
    20 本斯石斛
    21 叉唇石斛
    22 红蜻蜓石斛
    23 金果石斛
    24 红灯笼石斛
    25 黄贝壳石斛
    26 秋石斛D2015117
    27 密花石斛
    28 扭瓣石斛
    29 剑叶石斛
    30 亮叶石斛
    31 报春石斛
    32 董黑毛石斛
    33 澳洲石斛
    34 兜唇石斛
    35 重唇石斛
    36 秋石斛D2015123
    37 霍山石斛
    38 秋石斛-三亚阳光
    39 秋石斛-水晶
    40 秋石斛-出水芙蓉
    41 秋石斛-画眉
    42 秋石斛-樱桃红
    43 秋石斛-红粉佳人
    44 秋石斛D2015114
    45 秋石斛D2015121
    46 秋石斛-TretesMoon
    47 秋石斛D2015127
    48 秋石斛D2015128
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    表  2  石斛兰SRAP标记多态性分析

    Table  2.   Information on SRAP markers in Dendrobium

    引物名 引物序列 总条带 多态性条带 多态性比率/% 多态性信息含量
    Me1+Em2 5′-TGAGTCCAAACCGGATA-3′;5′-GACTGCGTACGAATTTGC-3′ 14 14 100.00 0.900
    Me1+Em3 5′-TGAGTCCAAACCGGATA-3′;5′-GACTGCGTACGAATTGAC-3′ 9 9 100.00 0.829
    Me1+Em8 5′-TGAGTCCAAACCGGATA-3′;5′-GACTGCGTACGAATTCTG-3′ 15 15 100.00 0.884
    Me2+Em1 5′-TGAGTCCAAACCGGAGC-3′;5′-GACTGCGTACGAATTAAT-3′ 9 9 100.00 0.840
    Me2+Em10 5′-TGAGTCCAAACCGGAGC-3′;5′-GACTGCGTACGAATTTAG-3′ 12 12 100.00 0.880
    Me3+Em4 5′-TGAGTCCAAACCGGAAT-3′;5′-GACTGCGTACGAATTTGA-3′ 13 13 100.00 0.900
    Me3+Em6 5′-TGAGTCCAAACCGGAAT-3′;5′-GACTGCGTACGAATTGCA-3′ 7 7 100.00 0.779
    Me4+Em2 5′-TGAGTCCAAACCGGACC-3′;5′-GACTGCGTACGAATTTGC-3′ 13 12 92.31 0.718
    Me6+Em6 5′-TGAGTCCAAACCGGTAA-3′;5′-GACTGCGTACGAATTGCA-3′ 11 11 100.00 0.868
    Me6+Em10 5′-TGAGTCCAAACCGGTAA-3′;5′-GACTGCGTACGAATTTAG-3′ 12 12 100.00 0.903
    Me7+Em2 5′-TGAGTCCAAACCGGTCC-3′;5′-GACTGCGTACGAATTTGC-3′ 10 9 90.00 0.730
    Me8+Em5 5′-TGAGTCCAAACCGGTGC-3′;5′-GACTGCGTACGAATTAAC-3′ 11 11 100.00 0.839
    Me10+Em2 5′-TGGGGACAACCCGGCTT-3′;5′-GACTGCGTACGAATTTGC-3′ 12 11 91.67 0.798
    Me10+Em8 5′-TGGGGACAACCCGGCTT-3′;5′-GACTGCGTACGAATTCTG-3′ 11 10 90.91 0.724
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出版历程
  • 收稿日期:  2018-01-22
  • 修回日期:  2018-04-02
  • 刊出日期:  2018-05-01

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