Genetic Relationship Among Grape Varieties in Fujian by ISSR Markers
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摘要: 利用ISSR-PCR分子标记技术对福建省各葡萄种植区收集到的196份葡萄资源进行亲缘关系鉴定。试验结果表明,12条引物可以清晰扩增出164条谱带,多态性位点的平均百分率为91.44%;聚类分析表明,196份葡萄资源可以分为3大类,即东亚种群、欧美杂种和欧亚种;群体遗传分析表明,葡萄资源种内存在丰富的遗传多样性。Abstract: Genetic relationships among 196 grape cultivars collected from various regions in Fujian were determined using ISSR-PCR. The 12 selected primers amplified 164 bands from the plants with up to 91.44% polymorphic loci. The clustering analysis revealed that the germplasms could be divided into three categories as the eastern Asia population, the inter-specific hybrids (Vitis vinifera V. labrusca) and V. vinifera. A population genetic polymorphism analysis on the cultivars showed abundant diversities among them.
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Key words:
- grape /
- genetic resource /
- ISSR /
- genetic relationship /
- clustering analysis
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表 1 葡萄品种资源
Table 1. Grape germplasms
编号 品种(系) 种群 采集地 编号 品种(系) 种群 采集地 编号 品种(系) 种群 采集地 1 维多利亚 欧亚种 福州 67 N4_1 - 建阳 133 B5_13 - 建阳 2 醉金香 欧美杂种 福州 68 脱毒巨峰 欧美杂种 建阳 134 B5_12 - 建阳 3 红提003 欧亚种 福州 69 碧香无核 欧亚种 建阳 135 B5_9 - 建阳 4 意大利 欧亚种 福州 70 矢富罗莎 欧亚种 建阳 136 红高峰 欧美杂种 建阳 5 金手指 欧美杂种 福州 71 贝达 美洲种 建阳 137 美秋 - 建阳 6 巨峰琅岐选育 欧美杂种 福州 72 延绿/本地种 - 建阳 138 维多利亚 欧亚种 建阳 7 藤稔 欧美杂种 福州 73 本地种 - 建阳 139 紫珍香 欧美杂种 建阳 8 宇选4号 欧美杂种 福州 74 D2_13 - 建阳 140 红双珠 - 建阳 9 美人指 欧亚种 福州 75 D2_3 - 建阳 141 京优 欧美杂种 建阳 10 巨玫瑰 欧美杂种 福州 76 D2_4 - 建阳 142 秦龙大穗 欧亚种 建阳 11 白罗莎里奥 欧亚种 福州 77 D2_5 - 建阳 143 秋黑 欧亚种 建阳 12 红罗莎里奥 欧亚种 福州 78 D2_6 - 建阳 144 红地球 欧亚种 建阳 13 红乳 欧亚种 福州 79 D2_1 - 建阳 145 B4_6 - 建阳 14 里扎马特 欧亚种 福州 80 D2_11 - 建阳 146 瑞必尔 欧亚种 建阳 15 宇选1号 欧美杂种 福州 81 D2_8 - 建阳 147 巨玫瑰 欧美杂种 建阳 16 香妃 欧亚种 福州 82 D2_2 - 建阳 148 美人指 欧亚种 建阳 17 北醇 欧山杂种 福州 83 D4_3 - 建阳 149 紫地球 欧亚种 建阳 18 甬优 欧美杂种 福州 84 D2_7 - 建阳 150 无核白鸡心 欧亚种 建阳 19 黄蜜 欧美杂种 福州 85 D3_9 - 建阳 151 黑元帅 欧美杂种 建阳 20 红提 欧亚种 福州 86 D3_8 - 建阳 152 北醇 欧山杂种 建阳 21 碧香无核 欧亚种 福州 87 D3_5 - 建阳 153 桂葡1号 欧山杂种 建阳 22 夏黑 欧美杂种 福州 88 D1_6 - 建阳 154 左优红 欧山杂种 建阳 23 巨峰 欧美杂种 泉州 89 D3_11右 - 建阳 155 京亚 欧美杂种 福州 24 夏黑024 欧美杂种 泉州 90 D3_7 - 建阳 156 婴儿子 - 福州 25 醉金香 欧美杂种 泉州 91 D4_7 - 建阳 157 早玉 欧亚种 福州 26 夏黑026 欧美杂种 泉州 92 D4_5 - 建阳 158 香妃 欧亚种 福州 27 赤霞珠 欧亚种 建阳 93 D1_13 - 建阳 159 夏黑 欧美杂种 福州 28 夏黑 欧美杂种 建阳 94 D1_13左 - 建阳 160 北醇 欧山杂种 福州 29 金田美指 欧亚种 建阳 95 D1_4 - 建阳 161 美人指 欧亚种 福州 30 红乳 欧亚种 建阳 96 D4_4 - 建阳 162 高妻 欧美杂种 福州 31 黄蜜 欧美杂种 建阳 97 着色香 欧美杂种 建阳 163 醉金香 欧美杂种 福州 32 金峰 欧美杂种 建阳 98 峰后 欧美杂种 建阳 164 红地球 欧亚种 福州 33 玫瑰香 欧亚种 建阳 99 D1_10右 - 建阳 165 青提 欧亚种 福州 34 巨峰变异 欧美杂种 建阳 100 D1_5 - 建阳 166 金星无核 欧美杂种 福州 35 台湾巨峰 欧美杂种 建阳 101 D2_13右 - 建阳 167 巨玫瑰 欧美杂种 福州 36 N1_1 - 建阳 102 D2_12 - 建阳 168 脱毒巨峰 欧美杂种 福州 37 早巨峰 欧美杂种 建阳 103 D2_10 - 建阳 169 地方种169 - 德化 38 京亚 欧美杂种 建阳 104 D1_10 - 建阳 170 野生种170 - 沙县 39 高妻 欧美杂种 建阳 105 D1_11 - 建阳 171 野生种171 - 沙县 40 魏可 欧亚种 建阳 106 D1_12 - 建阳 172 野生种172 - 沙县 41 冬香蕉 东亚种群 建阳 107 D3_6 - 建阳 173 巨峰塔形 - 沙县 42 香悦 欧美杂种 建阳 108 D4_1 - 建阳 174 夏黑 欧美杂种 明溪 43 寒香蜜 欧美杂种 建阳 109 D1_7 - 建阳 175 美夏40 欧亚种 明溪 44 蜜汁 欧美杂种 建阳 110 D4_6 - 建阳 176 未知品种 - 明溪 45 奥古斯特 欧亚种 建阳 111 D1_8 - 建阳 177 荣名5号 欧美杂种 明溪 46 藤稔 欧美杂种 建阳 112 D1_9 - 建阳 178 金田美指 欧亚种 明溪 47 醉金香 欧美杂种 建阳 113 温克/魏可 欧亚种 建阳 179 新美指 - 明溪 48 高蓓蕾 欧亚种 建阳 114 8611 欧美杂种 建阳 180 珍珠无核 欧美杂种 明溪 49 金手指 欧美杂种 建阳 115 D1_3 - 建阳 181 冬香蕉 东亚种群 明溪 50 B_44 - 建阳 116 先锋 欧美杂种 建阳 182 紫秋 东亚种群 明溪 51 B_48 - 建阳 117 黑旋风 欧美杂种 建阳 183 早玫瑰 欧亚种 明溪 52 B4_10 - 建阳 118 红旗特早玫瑰 欧亚种 建阳 184 刺葡萄1 东亚种群 福安 53 B4_12 - 建阳 119 坊绿/地方种 - 建阳 185 山葡萄1 东亚种群 福安 54 无核早红提 欧美杂种 建阳 120 D1_1 - 建阳 186 山葡萄2 东亚种群 福安 55 B4_13 - 建阳 121 D2_2 - 建阳 187 巨峰 欧美杂种 福安 56 六月紫 欧亚种 建阳 122 西拉 欧亚种 建阳 188 宇选4号 欧美杂种 福安 57 B5_5 - 建阳 123 蛇龙珠 欧亚种 建阳 189 白罗莎里奥 欧亚种 福安 58 霞多丽 欧亚种 建阳 124 B5_1 - 建阳 190 夏黑 欧美杂种 福安 59 烟73 欧亚种 建阳 125 白香蕉 欧美杂种 建阳 191 里扎马特 欧亚种 福安 60 烟74 欧亚种 建阳 126 B5_14 - 建阳 192 新美人指 欧亚种 福安 61 康拜尔 欧美杂种 建阳 127 B2_2 - 建阳 193 巨玫瑰 欧美杂种 福安 62 康可 美洲种 建阳 128 香葡萄 - 建阳 194 刺葡萄2 东亚种群 福安 63 巨峰 欧美杂种 建阳 129 赤霞珠129 欧亚种 建阳 195 刺葡萄3 东亚种群 福安 64 摩尔多瓦 欧美杂种 建阳 130 B3_3 - 建阳 196 169愈伤组织 - - 65 户太8号 欧美杂种 建阳 131 天缘奇 欧美杂种 建阳 66 蜜丽 欧美杂种 建阳 132 无核红宝石 欧亚种 建阳 表 2 12条引物序列及其PCR扩增结果
Table 2. Sequences and PCR amplifications of 12 primers
引物序号 引物序列 总扩增带数 多态性带数 多态性位点百分率/% UBC810 GAGAGAGAGAGAGAGAT 18 17 94.44 UBC811 GAGAGAGAGAGAGAGAC 12 11 91.67 UBC815 CTCTCTCTCTCTCTCTG 16 15 93.75 UBC823 TCTCTCTCTCTCTCTCC 12 10 83.33 UBC826 ACACACACACACACACC 12 10 83.33 UBC834 AGAGAGAGAGAGAGAGYT 11 11 100 UBC835 AGAGAGAGAGAGAGAGYC 11 7 63.64 UBC840 GAGAGAGAGAGAGAGAYT 17 17 100 UBC845 CTCTCTCTCTCTCTCTRG 15 15 100 UBC857 ACACACACACACACACYG 13 11 84.62 UBC864 ATGATGATGATGATGATG 15 14 93.33 UBC873 GACAGACAGACAGACA 12 12 100 总计 164 150 - 平均 13.67 12.50 91.44 表 3 葡萄资源遗传多样性分析
Table 3. Genetic variation of grape germplasms
居群 样本数 等位基因数 有效等位基因数 Nei′s基因多样性 Shannon信息指数 多态性位点 多态性位点百分率/% 东亚种群 10 1.5915±0.4931 1.3747±0.3863 0.2161±0.2046 0.3210±0.2911 97 59.15 欧美杂种 76 1.7561±0.4307 1.4102±0.3814 0.2390±0.1958 0.3602±0.2720 124 75.61 欧亚种 110 1.8171±0.3878 1.4240±0.3544 0.2535±0.1820 0.3859±0.2516 134 81.71 -
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