我国部分地区鸭1型甲肝病毒流行株遗传变异分析

傅光华; 陈翠腾; 温名根; 施少华; 陈红梅; 万春和; 傅秋玲; 程龙飞; 刘荣昌; 黄瑜

doi:10.19303/j.issn.1008-0384.2018.02.001

我国部分地区鸭1型甲肝病毒流行株遗传变异分析

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.02.001

傅光华^{1, 2},
陈翠腾^{1, 3},
温名根⁴,
施少华^{1, 2},
陈红梅^{1, 2},
万春和^{1, 2},
傅秋玲^{1, 2},
程龙飞^{1, 2},
刘荣昌^{1, 2},
黄瑜^{1, 2, 3, ,}

1.
福建省农业科学院畜牧兽医研究所, 福建福州 350013
2.
福建省禽病防治重点实验室, 福建福州 350013
3.
福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心, 福建福州 350013
4.
江西省吉安县畜牧兽医局, 江西吉安 343100

基金项目:

福建省自然科学基金项目 2015J01113

福建省科技计划项目——省属公益类科研院所基本科研专项 2015R1023-3

现代农业（水禽）产业技术体系建设专项 CARS-42

福建省农业科学院青年英才计划项目 YC2015-13

详细信息

作者简介:
傅光华(1977-), 男, 博士, 主要从事动物病毒分子生物学研究

通讯作者:
黄瑜(1965-), 男, 博士, 研究员, 硕士生导师, 主要从事动物传染病研究(E-mail:hangyu_815@163.com)

中图分类号: S852
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出版历程
- 收稿日期: 2017-10-25
- 修回日期: 2018-02-03
- 刊出日期: 2018-02-01

Epidemiology and Genetic Variation of Duck Hepatitis A Virus Type 1 Circulating in Some Regions of China

FU Guang-hua^{1, 2},
CHEN Cui-teng^{1, 3},
WEN Ming-gen⁴,
SHI Shao-hua^{1, 2},
CHEN Hong-mei^{1, 2},
WAN Chun-he^{1, 2},
FU Qiu-ling^{1, 2},
CHENG Long-fei^{1, 2},
LIU Rong-chang^{1, 2},
HUANG Yu^{1, 2, 3
, ,}

1.
Institute of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou, Fujian 350013, China
2.
Fujian Provincial Key Laboratory for Avian Diseases Control and Prevention, Fuzhou, Fujian 350013, China
3.
Fujian Animal Diseases Control Technology Center, Fuzhou, Fujian 350013, China
4.
Bureau of Animal Husbandry and Veterinary Medicine of Ji'an County of Jiangxi, Ji'an, Jiangxi 343100, China

摘要

摘要: 为了解鸭群中鸭1型甲肝病毒（DHAV-1）的流行及其分子变异情况，对2015-2016年福建、广东、浙江及江西鸭群采集的327份临床样品进行检测、病毒分离鉴定、序列测定与分析。结果表明，自327份临床样品中检出DHAV-1阳性样品35份，阳性率10.7%；从阳性样品中分离获得23株DHAV-1，主要来自30日龄以内的麻鸭和半番鸭。对DHAV-1的VP1基因分子特征及遗传变异分析，表明23株病毒VP1基因核苷酸序列同源性介于93.3%~99.9%，分属2个病毒亚群，两亚群间的遗传距离为0.06。23株临床分离株中有18株与引起雏鸭胰腺泛黄的毒株（MPZJ1206株）处于同一亚群，为目前流行的优势毒株，与国内外疫苗株核苷酸同源性在91.3%~96.2%，存在较大差异。由此可见，我国福建省及周边地区鸭群中不同DHAV-1流行株之间及流行毒株与疫苗株间均存在不同程度的差异。
- 鸭1型甲肝病毒 /
- VP1基因 /
- 变异分析
Abstract: The epidemic prevalence and molecular variation of duck hepatitis A virus type 1 (DHAV-1) were investigated. Three-hundred-twenty-seven clinical samples collected in 2015-2016 from Fujian and surrounding provinces were used for the virus detection and isolation. Thirty-five of these samples (10.7%)were found to be pusitive for DHAV-1. From the 35 positive specimens, 23 strains were isolated, mainly from shelducks and mule ducks of less than 30-day-old. The sequence analysis on VP1 gene of the 23 isolates showed 93.3%-99.9% homology, and the strains could be divided into 2 subgroups with a genetic distance of 0.06. Among them, 18 isolates clustered in a currently prevalent subgroup which contains the virus (MPZJ1206)causing yellowed-pancreas in ducklings. On the other hand, all 23 isolates shared merely 91.3-96.2% nucleotide sequence homology with the strain used for vaccination abroad and domestically. It appeared that genetic variations existed among the various DHAV-1 strains.
- duck hepatitis A virus type 1 /
- VP1 gene /
- variation analysis

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图 1 鸭1型甲肝病毒VP1基因遗传进化分析

注：图中树结处的阿拉伯数字为自举检验置信值(1 000次重复)，低于70的数值未显示；黑三角(▲)标注的毒株为本试验扩增的毒株。

Figure 1. Phylogenetic analysis on VP1 gene of DHAV-1

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图 2 DHAV-1不同基因亚型毒株VP1蛋白178~190位氨基酸序列

Figure 2. Sequences of 178-190 amino acids of VP1 proteins from viruses of different subgenotypes

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表 1 样品来源

Table 1. Sources of specimens

序号	省份	主要来源地	样品类型	样品数
1	福建	福州、莆田、漳州、三明、福清、南平、宁德	肝脏及脾脏等	187
2	广东	清远、湛江、广州、惠州	肝脏及脾脏等	65
3	浙江	金华、宁波、湖州	肝脏及脾脏等	42
4	江西	南昌、南城、吉安	肝脏及脾脏等	33
总计			肝脏及脾脏等	327

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表 2 分离毒株信息

Table 2. Information on isolated viruses

毒株名称	宿主	日龄/d	采集年份	主要剖检病变
FQ12SD-0111	麻鸭	12	2015	肝肿大出血
FQ10SD-0119	麻鸭	10	2015	肝肿大出血
FQ20SD-0131	麻鸭	20	2015	肝肿大出血
FZ12SD-0413	麻鸭	12	2015	胰腺泛黄
CL26SD-0426	麻鸭	26	2015	肝肿大出血
CL12SD-0425	麻鸭	12	2015	肝、肾肿大出血
CL12SD-0506	麻鸭	12	2015	肝肿大出血
MH07SD-0701	麻鸭	7	2015	肝肿大出血
MH09SD-0409	麻鸭	9	2015	肝出血
FQ06SD-0412	麻鸭	6	2015	肝、肾肿大出血
FZ10SD-0703	麻鸭	10	2015	肝、肾肿大出血
MH10MD-0515	半番鸭	10	2015	胰腺泛黄
GT15MD-0312	半番鸭	15	2015	肝出血
MH08MD-0409	半番鸭	8	2015	肝出血
YT15MD-0411	半番鸭	15	2015	胰腺泛黄
MH08MD-0417	半番鸭	8	2015	肝肿大出血
FZ167MD-0517	半番鸭	167	2016	肝出血，肾肿大
ZZ02MD-0617	半番胚	24	2016	-
GT30MD-0228	番鸭	30	2015	肝出血
GD20MD-0301	番鸭	20	2016	肝出血
SD23CD-0825	樱桃谷鸭	23	2015	肝、脾肿大出血
FZ10CD-0514	樱桃谷鸭	10	2016	肝出血
JH51Gu-0307	鹌鹑	未知	2015	肺脏出血、脑膜炎

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表 3 不同DHAV毒株VP1基因序列同源性分析

Table 3. Homology analysis on VP1 gene of DHAV isolates

基因型	毒株名称(分离年份)	序列同源性/%
基因型	毒株名称(分离年份)	核苷酸	氨基酸
DHAV-1	本研究分离株(2015-2016)	93.3~99.9	94.4~100
	FZ05(2005)	91.3~93.7	95.8~97.6
	ZJ(2007)	91.8~95.1	93.5~96.3
	03D(2005)	93.5~95.6	95.3~98.6
	LQ57(2011年前)	93.5~95.9	94.9~97.2
	H(1993)	92.7~95.4	95.8~98.1
	FJ1220(2012)	94.4~99.6	95.3~100
	GD(2012)	94.4~99.6	95.8~99.5
	MPZJ1206(2012)	94.3~99.7	94.9~99.5
	FJ1407(2014)	93.9~99.3	94.9~99.5
	JX1405(2014)	93.9~99.3	94.9~99.5
	Du/CH/LGD/111239(2011)	94.1~99.2	94.4~98.1
	Du/CH/LGD/111238(2011)	94.3~99.0	94.4~97.6
	A66(2006年前)	94.0~96.2	95.3~98.5
	CH60(2000)	94.1~96.2	95.8~98.5
	C80(2006年前)	94.1~96.4	95.8~99.0
DHAV-2	90D(1990)	64.9~67.1	68.9~71.2
DHAV-2	04G(2004)	65.1~67.2	69.2~72.5
DHAV-3	Du/CH/LJS/90905(2009)	67.3~70.2	75.7~78.2
	G(1999)	67.1~70.1	75.7~78.2
	AP03337(2004)	65.9~69.0	75.2~78.3

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