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丝瓜种质资源主成分与聚类分析

叶新如 朱海生 温庆放 李祖亮 刘建汀 王彬 陈敏氡 张前荣 黄爱萍

叶新如, 朱海生, 温庆放, 李祖亮, 刘建汀, 王彬, 陈敏氡, 张前荣, 黄爱萍. 丝瓜种质资源主成分与聚类分析[J]. 福建农业学报, 2017, 32(7): 703-709. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.07.003
引用本文: 叶新如, 朱海生, 温庆放, 李祖亮, 刘建汀, 王彬, 陈敏氡, 张前荣, 黄爱萍. 丝瓜种质资源主成分与聚类分析[J]. 福建农业学报, 2017, 32(7): 703-709. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.07.003
YE Xin-ru, ZHU Hai-sheng, WEN Qing-fang, LI Zu-liang, LIU Jian-ting, WANG Bin, CHEN Min-dong, ZHANG Qian-rong, HUANG Ai-ping. Principal Components and Cluster Analyses on Luffa Germplasms[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2017, 32(7): 703-709. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.07.003
Citation: YE Xin-ru, ZHU Hai-sheng, WEN Qing-fang, LI Zu-liang, LIU Jian-ting, WANG Bin, CHEN Min-dong, ZHANG Qian-rong, HUANG Ai-ping. Principal Components and Cluster Analyses on Luffa Germplasms[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2017, 32(7): 703-709. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.07.003

丝瓜种质资源主成分与聚类分析

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.07.003
基金项目: 

福建省科技计划项目——省属公益类科研院所基本科研专项 2015R1018-4

福建省科技计划项目——省属公益类科研院所基本科研专项 2016R1015-4

福建省农业科学院创新团队 2016PI-40

福建省自然科学基金项目 2015J01118

详细信息
    作者简介:

    叶新如(1991-), 女, 主要从事园艺植物分子生物学研究(E-mail:731122298@qq.com)

    通讯作者:

    朱海生(1978-), 男, 博士, 副研究员, 主要从事园艺植物生理生化与分子生物学研究(E-mail:zhs0246@163.com)

    温庆放(1965-), 男, 研究员, 研究方向:蔬菜育种(E-mail:fjvrc@163.com)

  • 中图分类号: S642.1

Principal Components and Cluster Analyses on Luffa Germplasms

  • 摘要: 对60份丝瓜种质资源的植株、果实等16个农艺性状进行主成分分析和聚类分析。结果表明,60份丝瓜种质资源变异系数范围在0~111%;多样性信息指数在0~2.037。各个材料之间的变异系数和多样性指数各不相同,但总体上60份丝瓜的变异程度和多样性较高。通过主成分分析,提取出5个农艺性状的指标。判断有棱丝瓜和普通丝瓜的因子、果肉因子、果形因子、熟性因子、外观品质因子。根据种质间遗传聚类丝瓜分为有棱丝瓜和普通丝瓜两大类。
  • 图  1  60份丝瓜种质资源UPGMA聚类

    Figure  1.  Dendrogram of 60 luffa accessions generated by UPGMA method

    表  1  供试材料

    Table  1.   Material tested

    编号材料种质类型
    105005-2-3-3-4-6普通丝瓜
    208002-1-3-4-1-8普通丝瓜
    311009-1-2-1-3-2有棱丝瓜
    411010-1-5-1-3-6有棱丝瓜
    511014-3-9-3-2-10有棱丝瓜
    611014-3-2-3-4-5有棱丝瓜
    711016-4-4-1-5-1有棱丝瓜
    811017-3-6-4-3-1普通丝瓜
    911027-2-9-4-6-3有棱丝瓜
    1005008-1-2-2-2-5普通丝瓜
    1107001-1-1-1-9-1有棱丝瓜
    1208002-1-7-3-4-7有棱丝瓜
    1308012-1-7-4-3-3有棱丝瓜
    1411016-4-5-2-5-6有棱丝瓜
    1511027-2-10-2-4有棱丝瓜
    1611027-2-11-4-5-1有棱丝瓜
    1713010-1-1-13-2普通丝瓜
    1811009-1-1-11-1-4普通丝瓜
    1911017-3-8-4-8-8普通丝瓜
    2009001-4-3-2-1-7有棱丝瓜
    2111019-1-3-9-1-2有棱丝瓜
    2213003-1-5-8-3-3普通丝瓜
    2311010-1-1-9-4有棱丝瓜
    2411014-3-10-3-5有棱丝瓜
    2512001-1-3-2-1-4普通丝瓜
    2606001-1-1-5-9普通丝瓜
    2706001-2-1-4-6普通丝瓜
    2805003-1-2-2-4普通丝瓜
    2911012-1-14-5-9有棱丝瓜
    3011002-1-3-5-8普通丝瓜
    3105008-1-2-2-2-1普通丝瓜
    3211011-1-11-4-5-3有棱丝瓜
    3305006-1-1-7-9-2有棱丝瓜
    3407001-1-12-6-4-3有棱丝瓜
    3505006-1-3-4-6-5有棱丝瓜
    3611012-2-14-9-6-3有棱丝瓜
    3711019-1-3-1-4-5有棱丝瓜
    3811024-4-4-6-9-6普通丝瓜
    3912001-1-3-1-5-1普通丝瓜
    4011007-1-1-5-3-3有棱丝瓜
    4113003-2-3-6-5-4普通丝瓜
    4214001-1-6-9-5-2普通丝瓜
    4314002-3-4-7-5-2普通丝瓜
    4405005-2-5-9-6-1普通丝瓜
    4505007-2-1-5-7-1普通丝瓜
    4611004-1-3-6-1-5-2普通丝瓜
    4711012-1-3-7-6-9-6有棱丝瓜
    4813011-1-5-6-9-5普通丝瓜
    4913012-1-4-6-9-3普通丝瓜
    5011019-5-3-9-6-7有棱丝瓜
    5112001-1-4-5-3-4普通丝瓜
    5211015-1-4-6-9-7有棱丝瓜
    5305003-1-2-1-6-9-9普通丝瓜
    5407004-1-2-1-5-4普通丝瓜
    5511020-2-2-9-8-4普通丝瓜
    5611007-2-1-6-4-1普通丝瓜
    5711012-1-8-6-2-5有棱丝瓜
    5811004-1-1-9-5-8普通丝瓜
    5911015-1-2-5-3-6有棱丝瓜
    6008012-1-9-2-2-6有棱丝瓜
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    表  2  形态性状记载

    Table  2.   Morphological characteristics of luffa

    形态性状记载标准
    第一雌花节位第_节
    瓜重_kg
    瓜长_cm
    瓜横径_cm
    果肉厚_cm
    瓜把长_cm
    生长势1弱2中3强
    瓜棱0无棱1微棱2浅棱3深棱
    叶形1心脏形2掌状浅裂3掌状深裂
    结瓜习性1主蔓2侧蔓3主/侧蔓
    瓜皮色1白2黄白3橙红4黄绿5浅绿6绿7深绿
    瓜肉色1白2白绿3黄绿4浅绿
    瓜面特征1平滑2微皱3粗糙
    瓜形1长棍棒2段棍棒3长圆筒4段圆筒5椭圆形6纺锤形7镰刀形8束腰形9蛇形
    瓜面光泽1灰暗2较光亮3光亮
    瓜瘤稀密0无1稀2中3密
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    表  3  植物学性状多样性基本统计数据

    Table  3.   Statistic diversity indices based on morphology of luffa

    性状最小值最大值均值标准差变异系数多样性指数
    瓜长13.753.0032.811.060.3371.317
    瓜横径1.987.805.041.1470.2281.988
    瓜皮色4.006.004.900.7520.1541.068
    瓜把长1.267.023.941.2850.3262.037
    瓜形1.004.002.401.1530.4801.371
    瓜面光泽1.003.002.460.7240.2940.927
    瓜瘤稀密0.003.001.111.2361.1101.207
    果肉厚0.325.042.611.1670.4461.949
    生长势2.003.002.750.4360.1580.562
    结瓜习性1.003.001.710.6910.4030.992
    瓜肉色1.003.001.750.5710.3260.866
    第1雌花节位6.0032.0016.95.3180.3151.824
    单瓜质量0.100.930.370.1600.4251.988
    瓜棱0.003.001.501.5121.0000.693
    瓜面特征2.003.002.260.4450.1970.579
    叶形2.002.002.000.0000.0000.000
    注:各性状最大值、最小值和均值的记载超标准见表 2
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    表  4  60份丝瓜田间性状调查结果

    Table  4.   60 Characteristics of luffa in the field

    编号瓜长/cm瓜横径/cm瓜把长/cm单瓜重量/kg第1雌花节位果肉厚/cm
    119.876.005.120.4016.04.92
    220.124.914.080.308.02.58
    325.004.603.830.3319.01.87
    446.005.004.540.5823.02.86
    513.785.334.680.2422.02.54
    621.003.333.810.1520.01.03
    721.005.504.220.237.02.13
    845.304.403.580.4020.02.88
    914.004.003.610.3332.01.98
    1014.004.303.570.2819.73.01
    1118.004.402.760.1422.01.34
    1219.205.004.560.1922.03.35
    1330.006.005.120.2120.03.04
    1426.414.104.420.2411.01.76
    1528.515.244.120.2917.51.36
    1614.007.004.760.2322.04.65
    1715.004.302.890.2517.01.75
    1819.706.005.580.7122.04.67
    1931.075.617.020.4417.04.07
    2032.003.284.920.156.03.54
    2132.005.004.450.3817.02.81
    2215.004.303.980.3715.02.65
    2335.307.705.980.4619.05.04
    2432.736.335.120.4819.03.31
    2524.383.762.630.2415.01.05
    2627.826.305.780.6715.64.78
    2729.006.005.010.4419.04.32
    2827.004.303.860.3521.01.67
    2944.805.903.980.5521.03.23
    3023.595.312.860.3416.03.97
    3126.505.004.010.4018.62.12
    3232.794.635.670.418.01.88
    3346.104.903.820.4212.01.34
    3447.002.613.140.1211.00.98
    3548.214.003.550.3412.01.34
    3648.003.502.540.2731.01.54
    3736.575.453.180.5110.02.21
    3833.306.722.040.2421.04.53
    3939.005.843.360.429.03.44
    4033.471.984.630.1022.00.32
    4152.307.802.160.6516.04.33
    4243.603.812.360.3911.01.55
    4347.005.972.640.3214.03.82
    4443.604.951.940.2616.02.75
    4537.325.636.630.5716.03.65
    4649.705.782.320.3522.02.45
    4730.216.226.710.5122.01.42
    4831.004.862.760.3718.02.01
    4953.005.572.270.3811.03.21
    5038.806.505.640.4921.03.43
    5142.003.452.890.3122.01.43
    5239.255.343.690.5115.01.78
    5340.174.925.710.4810.03.67
    5439.565.463.730.5914.02.32
    5534.304.492.190.9311.01.43
    5650.603.163.040.5318.61.14
    5734.006.143.960.4220.02.08
    5841.804.723.260.3811.02.23
    5933.604.571.260.1414.02.11
    6031.005.264.660.5516.02.23
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    表  5  60份丝瓜种质资源田间性状调查结果

    Table  5.   Characteristics of 60 luffa germplasms observed by field survey

    编号瓜形瓜皮色瓜面光泽瓜面特征瓜瘤稀密瓜肉色瓜棱结瓜习性生长势叶形
    1短圆筒绿灰暗微皱白绿无棱主蔓掌状浅裂
    2短圆筒绿灰暗微皱白绿无棱主蔓掌状浅裂
    3短棍棒绿较光亮粗糙深棱侧蔓掌状浅裂
    4长棍棒深绿光亮微皱白绿深棱侧蔓掌状浅裂
    5短棍棒绿较光亮微皱深棱主/侧蔓掌状浅裂
    6短棍棒深绿较光亮微皱白绿深棱主/侧蔓掌状浅裂
    7短棍棒绿较光亮微皱深棱侧蔓掌状浅裂
    8短圆筒绿灰暗粗糙无棱主蔓掌状浅裂
    9短棍棒浅绿光亮微皱深棱侧蔓掌状浅裂
    10短圆筒绿光亮粗糙白绿无棱主蔓掌状浅裂
    11短棍棒浅绿光亮微皱白绿深棱主/侧蔓掌状浅裂
    12短棍棒深绿较光亮微皱深棱侧蔓掌状浅裂
    13短棍棒深绿光亮微皱深棱侧蔓掌状浅裂
    14短棍棒深绿光亮微皱白绿深棱侧蔓掌状浅裂
    15短棍棒绿光亮微皱白绿深棱侧蔓掌状浅裂
    16短棍棒浅绿光亮微皱深棱侧蔓掌状浅裂
    17短圆筒绿光亮微皱白绿无棱侧蔓掌状浅裂
    18短圆筒深绿灰暗微皱白绿无棱侧蔓掌状浅裂
    19长圆筒浅绿光亮粗糙白绿无棱侧蔓掌状浅裂
    20棍棒棒浅绿较光亮微皱白绿深棱侧蔓掌状浅裂
    21长棍棒绿光亮微皱深棱主蔓掌状浅裂
    22短圆筒绿灰暗粗糙白绿无棱侧蔓掌状浅裂
    23长棍棒绿光亮微皱白绿深棱侧蔓掌状浅裂
    24长棍棒深绿光亮微皱深棱主/侧蔓掌状浅裂
    25短圆筒浅绿光亮粗糙黄绿无棱主蔓掌状浅裂
    26短圆筒浅绿较光亮粗糙白绿无棱主蔓掌状浅裂
    27短圆筒浅绿较光亮微皱白绿无棱主蔓掌状浅裂
    28短圆筒浅绿较光亮微皱黄绿无棱侧蔓掌状浅裂
    29长棍棒浅绿光亮微皱白绿深棱侧蔓掌状浅裂
    30短圆筒浅绿光亮微皱白绿无棱主蔓掌状浅裂
    31短圆筒绿光亮微皱白绿无棱主蔓掌状浅裂
    32长棍棒绿较光亮微皱深棱主蔓掌状浅裂
    33长棍棒绿较光亮微皱白绿深棱主蔓掌状浅裂
    34长棍棒深绿光亮微皱白绿深棱主蔓掌状浅裂
    35长棍棒深绿光亮微皱深棱主/侧蔓掌状浅裂
    36长棍棒深绿光亮粗糙白绿深棱侧蔓掌状浅裂
    37长棍棒绿较光亮微皱白绿深棱主蔓掌状浅裂
    38长圆筒浅绿光亮粗糙无棱主/侧蔓掌状浅裂
    39长圆筒浅绿光亮粗糙无棱主蔓掌状浅裂
    40长棍棒深绿较光亮微皱白绿深棱侧蔓掌状浅裂
    41长圆筒绿灰暗粗糙白绿无棱主蔓掌状浅裂
    42长圆筒绿光亮粗糙白绿无棱主蔓掌状浅裂
    43长圆筒绿光亮微皱白绿无棱主蔓掌状浅裂
    44长圆筒浅绿光亮微皱黄绿无棱主蔓掌状浅裂
    45长圆筒绿光亮微皱黄绿无棱主蔓掌状浅裂
    46长圆筒浅绿较光亮微皱白绿无棱主蔓掌状浅裂
    47长棍棒浅绿光亮微皱白绿深棱侧蔓掌状浅裂
    48长圆筒浅绿光亮微皱白绿无棱侧蔓掌状浅裂
    49长圆筒绿光亮微皱无棱主蔓掌状浅裂
    50长棍棒深绿光亮微皱深棱侧蔓掌状浅裂
    51长圆筒绿光亮微皱无棱侧蔓掌状浅裂
    52长棍棒深绿光亮微皱白绿深棱侧蔓掌状浅裂
    53长圆筒绿灰暗粗糙无棱主蔓掌状浅裂
    54长圆筒绿灰暗粗糙白绿无棱侧蔓掌状浅裂
    55长圆筒浅绿较光亮粗糙白绿无棱主蔓掌状浅裂
    56长圆筒绿光亮粗糙白绿无棱主/侧蔓掌状浅裂
    57长棍棒深绿光亮微皱深棱侧蔓掌状浅裂
    58长圆筒浅绿光亮微皱白绿无棱侧蔓掌状浅裂
    59长棍棒浅绿光亮微皱白绿深棱主蔓掌状浅裂
    60长棍棒绿较光亮微皱白绿深棱主/侧蔓掌状浅裂
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    表  6  前5个主成分的特征向量、特征值和贡献率

    Table  6.   Eigenvectors, eigenvalues and contribution rates of 5 predominant components

    特征性状主成分1主成分2主成分3主成分4主成分5
    瓜形-0.0810.424-0.797-0.185-0.018
    瓜长0.192-0.5210.7370.0740.089
    瓜横径0.2450.7040.4390.204-0.209
    瓜把长-0.1630.6670.166-0.2090.047
    瓜皮色-0.5090.0040.234-0.2880.454
    瓜面光泽-0.292-0.2860.1110.461-0.284
    瓜面特征0.593-0.119-0.080-0.0560.568
    瓜肉色0.354-0.296-0.2230.041-0.314
    瓜瘤稀密0.880-0.151-0.219-0.0230.160
    单瓜质量0.5060.2460.512-0.0400.252
    瓜棱-0.8930.0700.204-0.019-0.031
    结瓜习性-0.5560.124-0.0840.2940.435
    第1雌花节位-0.2440.260-0.2240.6700.361
    生长势0.5610.150-0.1550.5050.124
    果肉厚0.3890.7310.2400.047-0.191
    特征值3.6132.3032.0111.4441.223
    贡献率%24.08915.35113. 4059.6298.155
    累计贡献率%24.08939.4452.84562.47470.629
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出版历程
  • 收稿日期:  2016-10-10
  • 修回日期:  2017-04-07
  • 刊出日期:  2017-07-01

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