Genetic Relationship among Guava Germplasms Accessed by Using ISSR Markers
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摘要: 采用ISSR分子标记技术对36份番石榴种质资源的亲缘关系进行分析,PCR产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳后,通过非加权配对算术平均法(UPGMA)进行数据分析,建立种质资源间的亲缘关系;从100条ISSR引物中筛选出9条多态性较丰富且稳定的引物,共扩增出165条带,其中多态性条带129条,多态性百分率为78.18%;扩增结果可将36份种质资源较好地区分开,各种质间遗传相似系数为0.70~0.93,平均遗传相似系数为0.815;在遗传相似系数0.75处,可将36份种质资源分成4组,与形态分类结果大致相符合。结果表明所收集的番石榴种质资源遗传基础较狭窄,但ISSR分子标记技术能较好地鉴别这些种质资源。Abstract: Using ISSR molecular markers, PCR products of 36 guava germplasms were purified by polyacrylamide gel electrophoresis and photographed the images for a UPGMA analysis to establish the genetic relationship. Out of 100 UBC series ISSR primers, 9 rich and stable polymorphic primers were selected and 165 bands amplified. Among the 165 bands, 129 were polymorphic rendering a polymorphism percentage of 78.18%. The amplified results could satisfactorily distinguish the 36 germplasms. The genetic similarity coefficient of all samples ranged from 0.70 to 0.93, averaging 0.815. At the coefficient of 0.75, the 36 germplasms were divided into 4 groups. The results were consistent with the morphological classification. Although the genetic basis for classification was weak, with the aid of ISSR molecular markers, clear identifications for the individual germplasms of the collection were obtained.
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Key words:
- guava /
- ISSR /
- genetic relationship
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表 1 供试资源及取样地点
Table 1. Sources of germplasms and sampling sites
编号 资源名称 取样地点 1 龙州1号 广西壮族自治区亚热带作物研究所番石榴种质资源圃 2 龙州2号 3 龙州3号 4 长果新世纪番石榴 5 圆果新世纪番石榴 6 新世纪实生番石榴 7 新西兰番石榴 8 嘉缘番石榴 9 珍珠番石榴 10 梨形番石榴 11 东兴农家种番石榴 12 汕红番石榴 13 老虎岭番石榴 14 琼番石榴17号 15 泰国大果番石榴 16 全红番石榴 17 维邦1号 18 维邦2号 19 维邦3号 20 景洪1号 云南省西双版纳热作所资源圃 21 景洪2号 22 河口1号 云南省红河热带农业科学研究所 23 河口2号 24 小平田1号 云南省保山市隆阳区热经所 25 小平田2号 26 南宁本地番石榴1号 广西壮族自治区亚热带作物研究所番石榴种质资源圃 27 南宁本地番石榴3号 28 南宁本地番石榴6号 29 南宁本地番石榴7号 30 南宁本地番石榴9号 31 南宁本地番石榴10号 32 迷你番石榴 33 南宁本地番石榴实生1号 34 南宁本地番石榴实生2号 35 八桂田园番石榴 36 南宁本地番石榴8号 注:供试种质名称为收集种质时所采用的品种名,品种名不明确的,以收集地或植株果实特征命名。所有供试种质通过嫁接现均保存于广西壮族自治区亚热带作物研究所番石榴种质资源圃内。 表 2 ISSR引物序列及其扩增结果
Table 2. ISSR primer sequence and amplification
引物编号 引物序列 总条带数/条 多态性条带/条 多态性带比例/% UBC810 gagagagagagagagat 15 13 86.67 UBC811 gagagagagagagagac 22 19 86.36 UBC812 gagagagagagagagaa 20 16 80 UBC841 gagagagagagagagayc 20 12 60 UBC842 gagagagagagagagayg 16 9 56.25 UBC857 acacacacacacacacyg 13 13 100 UBC861 accaccaccaccaccacc 14 9 64.29 UBC889 dbdacacacacacacac 17 12 70.59 UBC890 vhvgtgtgtgtgtgtgt 28 26 92.86 合计 165 129 78.18 -
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