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铁观音及黄棪半同胞系种质遗传多样性的ISSR分析

陈志丹 王安莉 孙威江

陈志丹, 王安莉, 孙威江. 铁观音及黄棪半同胞系种质遗传多样性的ISSR分析[J]. 福建农业学报, 2016, 31(10): 1059-1064. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.10.011
引用本文: 陈志丹, 王安莉, 孙威江. 铁观音及黄棪半同胞系种质遗传多样性的ISSR分析[J]. 福建农业学报, 2016, 31(10): 1059-1064. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.10.011
CHEN Zhi-dan, WANG An-li, SUN Wei-jiang. Genetic Diversity of Tieguanyin and Huangdan Half-sib Tea Cultivars Determined by Using ISSR Markers[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2016, 31(10): 1059-1064. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.10.011
Citation: CHEN Zhi-dan, WANG An-li, SUN Wei-jiang. Genetic Diversity of Tieguanyin and Huangdan Half-sib Tea Cultivars Determined by Using ISSR Markers[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2016, 31(10): 1059-1064. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.10.011

铁观音及黄棪半同胞系种质遗传多样性的ISSR分析

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.10.011
基金项目: 

国家863计划项目 2013AA10260605

福建省高校产学合作项目 2015N5008

福建省科技重大专项专题项目 2015NZ0002-1

详细信息
    作者简介:

    陈志丹(1984-), 男, 讲师, 博士, 研究方向:茶树种质资源与分子遗传育种研究(E-mail:asbulletdan@163.com)

    通讯作者:

    孙威江(1964-), 男, 教授, 博士, 研究方向:茶树种质资源研究与利用及茶叶质量安全与标准化研究(E-mail:swj8103@126.com)

  • 中图分类号: S571.1

Genetic Diversity of Tieguanyin and Huangdan Half-sib Tea Cultivars Determined by Using ISSR Markers

  • 摘要: 铁观音和黄棪是乌龙茶茶树育种的骨干亲本,以这2份品种及其为亲本选育出的新种质及不同地域种质的铁观音茶树为研究材料,采用ISSR分子标记技术,利用筛选出的9个多态性较好、扩增条带较清晰的ISSR引物,分别对24份茶树品种(系)进行扩增,分析其遗传多样性和亲缘关系。结果表明:9个ISSR引物共扩增出73条稳定的谱带,其中47条具有多态性,多态性比率为64.4%,平均每个引物扩增出5.2条谱带;遗传相似性分析显示24份供试种质的遗传相似系数0.544~0.889,平均为0.727,表明供试种质的遗传基础较窄,亲缘关系较近。
  • 图  1  引物826对24份茶树DNA扩增产物的琼脂糖凝胶电泳结果

    注:M为Marker,1~24:表示1~24号供试样品。

    Figure  1.  Agarose gel electrophoresis of amplified products from 24 cultivars using primer 826

    图  2  基于Jaccard相似系数的24份茶树品种(系)的聚类

    Figure  2.  Dendrograms of 24 tea cultivars based on Jaccard similarity coefficient

    表  1  供试品种(系)及其亲本来源和采样地点

    Table  1.   Locations and origins of tea cultivars used for experimentation

    序号/编号 品种(系)名称 亲本/来源 采集地点
    1 黄观音(茗科2号) 铁观音×黄棪 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    2 黄玫瑰 黄观音×黄棪 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    3 铁观音 - 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    4 凤圆春 铁观音自然杂交后代 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    5 白芽奇兰 - 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    6 悦茗香 赤叶观音 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    7 金观音(茗科1号) 铁观音×黄棪 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    8 品系1 铁观音×黄棪 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    9 紫玫瑰 铁观音×黄棪 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    10 品系2 铁观音×黄棪 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    11 瑞香 黄棪自然杂交后代 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    12 金牡丹 铁观音×黄棪 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    13 铁观音1 - 安溪县虎邱镇湖西村
    14 铁观音2 - 安溪县芦田镇福岭村
    15 铁观音3 - 安溪县西坪镇松岩村
    16 铁观音4 - 三明市大田县吴山镇
    17 铁观音5 - 安溪茶叶科学研究所种质资源圃
    18 铁观音6 - 安溪县虎邱镇茶树良种繁育基地
    19 铁观音7 - 安溪县芦田镇芦田村
    20 铁观音8 - 三明市大田县屏山乡
    21 铁观音9 - 安溪县芦田镇招坑村
    22 春兰 铁观音自然杂交后代 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    23 黄奇 黄棪×白芽奇兰 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
    24 黄棪 - 福建省农业科学院茶叶研究所种质资源圃
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    表  2  9条ISSR引物的扩增多态性

    Table  2.   Amplification polymorphism of 9 ISSR primers

    引物 退火温度/℃ 扩增条带数 多态性条带数 多态性百分率/%
    UBC-811 52.59 6 3 50.0
    UBC-815 49.85 8 3 37.5
    UBC-826 52.59 7 5 71.4
    UBC-835 54.16 7 5 71.4
    UBC-841 54.16 7 3 42.7
    UBC-845 54.16 12 10 83.5
    UBC-853 53.90 9 6 66.7
    UBC-857 54.16 10 6 60.0
    UBC-880 53.60 7 6 85.7
    合计 - 73 47 -
    平均 - 8.1 5.2 64.4
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    表  3  24份茶树品种(系)的Jaccard遗传相似系数

    Table  3.   Jaccard genetic similarity coefficients of 24 tea cultivars

    编号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24
    1 1.000 0.714 0.712 0.623 0.755 0.750 0.712 0.741 0.720 0.800 0.691 0.638 0.796 0.673 0.673 0.731 0.731 0.722 0.731 0.679 0.610 0.755 0.661 0.706
    2 0.714 1.000 0.745 0.623 0.686 0.714 0.648 0.741 0.720 0.636 0.755 0.667 0.725 0.673 0.673 0.765 0.667 0.632 0.731 0.709 0.638 0.691 0.661 0.776
    3 0.712 0.745 1.000 0.655 0.750 0.712 0.709 0.678 0.750 0.638 0.661 0.667 0.788 0.796 0.830 0.863 0.727 0.719 0.863 0.833 0.786 0.782 0.717 0.769
    4 0.623 0.623 0.655 1.000 0.725 0.593 0.596 0.655 0.544 0.673 0.638 0.617 0.698 0.621 0.679 0.673 0.673 0.667 0.643 0.714 0.617 0.667 0.563 0.648
    5 0.755 0.686 0.750 0.725 1.000 0.720 0.750 0.714 0.660 0.769 0.696 0.644 0.765 0.709 0.679 0.704 0.736 0.727 0.736 0.714 0.702 0.727 0.639 0.679
    6 0.750 0.714 0.712 0.593 0.720 1.000 0.712 0.709 0.686 0.698 0.661 0.667 0.692 0.673 0.614 0.667 0.698 0.661 0.667 0.621 0.638 0.691 0.661 0.706
    7 0.712 0.648 0.709 0.596 0.750 0.712 1.000 0.737 0.655 0.667 0.607 0.695 0.722 0.702 0.672 0.696 0.696 0.719 0.667 0.650 0.695 0.690 0.717 0.614
    8 0.741 0.741 0.678 0.655 0.714 0.709 0.737 1.000 0.714 0.754 0.776 0.667 0.719 0.672 0.672 0.724 0.754 0.661 0.667 0.677 0.667 0.746 0.714 0.702
    9 0.720 0.720 0.750 0.544 0.660 0.686 0.655 0.714 1.000 0.704 0.727 0.590 0.667 0.709 0.709 0.736 0.704 0.638 0.704 0.684 0.672 0.759 0.724 0.712
    10 0.800 0.636 0.638 0.673 0.769 0.698 0.667 0.754 0.704 1.000 0.707 0.578 0.679 0.633 0.633 0.627 0.655 0.678 0.627 0.667 0.578 0.737 0.600 0.632
    11 0.691 0.755 0.661 0.638 0.696 0.661 0.607 0.776 0.727 0.707 1.000 0.677 0.702 0.712 0.683 0.707 0.737 0.672 0.707 0.717 0.705 0.700 0.754 0.745
    12 0.638 0.667 0.667 0.617 0.644 0.667 0.695 0.667 0.590 0.578 0.677 1.000 0.768 0.776 0.689 0.683 0.712 0.793 0.712 0.694 0.738 0.705 0.677 0.690
    13 0.796 0.725 0.788 0.698 0.765 0.692 0.722 0.719 0.667 0.679 0.702 0.768 1.000 0.846 0.811 0.774 0.741 0.796 0.808 0.815 0.707 0.764 0.700 0.717
    14 0.673 0.673 0.796 0.621 0.709 0.673 0.702 0.672 0.709 0.633 0.712 0.776 0.846 1.000 0.887 0.815 0.815 0.804 0.849 0.821 0.776 0.772 0.767 0.727
    15 0.673 0.673 0.830 0.679 0.679 0.614 0.672 0.672 0.709 0.633 0.683 0.689 0.811 0.887 1.000 0.849 0.782 0.772 0.849 0.889 0.746 0.772 0.738 0.696
    16 0.731 0.765 0.863 0.673 0.704 0.667 0.696 0.724 0.736 0.627 0.707 0.683 0.774 0.815 0.849 1.000 0.811 0.768 0.882 0.818 0.741 0.768 0.763 0.788
    17 0.731 0.667 0.727 0.673 0.736 0.698 0.696 0.754 0.704 0.655 0.737 0.712 0.741 0.815 0.782 0.811 1.000 0.800 0.846 0.754 0.741 0.800 0.793 0.788
    18 0.722 0.632 0.719 0.667 0.727 0.661 0.719 0.661 0.638 0.678 0.672 0.793 0.796 0.804 0.772 0.768 0.800 1.000 0.833 0.776 0.733 0.789 0.698 0.684
    19 0.731 0.731 0.863 0.643 0.736 0.667 0.667 0.667 0.704 0.627 0.707 0.712 0.808 0.849 0.849 0.882 0.846 0.833 1.000 0.887 0.804 0.800 0.733 0.755
    20 0.679 0.709 0.833 0.714 0.714 0.621 0.650 0.677 0.684 0.667 0.717 0.694 0.815 0.821 0.889 0.818 0.754 0.776 0.887 1.000 0.810 0.776 0.714 0.702
    21 0.610 0.638 0.786 0.617 0.702 0.638 0.695 0.667 0.672 0.578 0.705 0.738 0.707 0.776 0.746 0.741 0.741 0.733 0.804 0.810 1.000 0.705 0.758 0.690
    22 0.755 0.691 0.782 0.667 0.727 0.691 0.690 0.746 0.759 0.737 0.700 0.705 0.764 0.772 0.772 0.768 0.800 0.789 0.800 0.776 0.705 1.000 0.726 0.778
    23 0.661 0.661 0.717 0.563 0.639 0.661 0.717 0.714 0.724 0.600 0.754 0.677 0.700 0.767 0.738 0.763 0.793 0.698 0.733 0.714 0.758 0.726 1.000 0.712
    24 0.706 0.776 0.769 0.648 0.679 0.706 0.614 0.702 0.712 0.632 0.745 0.690 0.717 0.727 0.696 0.788 0.788 0.684 0.755 0.702 0.690 0.778 0.712 1.000
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出版历程
  • 收稿日期:  2016-07-26
  • 修回日期:  2016-09-23
  • 刊出日期:  2016-10-28

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