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猪传染性胃肠炎病毒福建株M基因的克隆与生物信息学分析

朱晓琳 王劭 陈少莺 林锋强 程晓霞 陈仕龙 朱小丽 李兆龙

朱晓琳, 王劭, 陈少莺, 林锋强, 程晓霞, 陈仕龙, 朱小丽, 李兆龙. 猪传染性胃肠炎病毒福建株M基因的克隆与生物信息学分析[J]. 福建农业学报, 2011, 26(6): 925-929.
引用本文: 朱晓琳, 王劭, 陈少莺, 林锋强, 程晓霞, 陈仕龙, 朱小丽, 李兆龙. 猪传染性胃肠炎病毒福建株M基因的克隆与生物信息学分析[J]. 福建农业学报, 2011, 26(6): 925-929.
ZHU Xiao-lin, WANG Shao, CHEN Shao-ying, LIN Feng-qiang, CHENG Xiao-xia, CHEN Shi-long, ZHU Xiao-li, LI Zhao-long. Cloning and Bioinformatics Analysis of M Gene of Porcine Transmissible Gastroenteritis Virus Fujian Strain[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2011, 26(6): 925-929.
Citation: ZHU Xiao-lin, WANG Shao, CHEN Shao-ying, LIN Feng-qiang, CHENG Xiao-xia, CHEN Shi-long, ZHU Xiao-li, LI Zhao-long. Cloning and Bioinformatics Analysis of M Gene of Porcine Transmissible Gastroenteritis Virus Fujian Strain[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2011, 26(6): 925-929.

猪传染性胃肠炎病毒福建株M基因的克隆与生物信息学分析

基金项目: 

福建省财政专项福建省农业科学院创新团队项目(STIF-Y02);福建省科技计划项目省属公益类科研院所基本科研专项(2010R1025-1)

详细信息
    作者简介:

    陈少莺(1962-),女,研究员,主要从事动物传染病病原与防治研究(E-mail:chensy58@163.com)

  • 中图分类号: S 852

Cloning and Bioinformatics Analysis of M Gene of Porcine Transmissible Gastroenteritis Virus Fujian Strain

  • 摘要: 对猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV)福建分离株(TGEV-FJ株)M基因进行克隆、测序,并利用生物信息学技术分析TGEV-FJ株M蛋白基因的同源性、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点及其二级结构。结果显示,成功扩增出M基因完整目的片段(789 bp),编码262个氨基酸,构建了M基因的克隆重组质粒pGEM-T-M。序列分析与遗传进化树显示,TGEV M基因属高度保守的基因,TGEV-FJ株与HN2002株亲缘较近。TGEV-FJ株M蛋白具有一个潜在信号肽剪切位点(ACG16-17ER),存在3个潜在的N-糖基化位点,丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点分别有6个、1个和5个;TGEV-FJ株M蛋白二级结构-螺旋区域占11.59%,-折叠区域占44.93%,无规则卷曲区域占43.48%。
  • [1] ESCORS D,ORTEGO J,ENJUANES L,et al.The membrane M protein car boxy terminal binds to transmissible gastroenteritis coronavirus core and contributes to core stability[J].J Virol,2001,75(3):1312-1324.
    [2]
    [3] 韩国全.猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株M基因序列分析、原核表达研究及真核表达载体构建.四川:四川农业大学,2006.
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出版历程
  • 收稿日期:  2011-07-27
  • 修回日期:  2011-08-19
  • 刊出日期:  2011-12-15

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