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荧光定量PCR技术检测红壤稻田土壤厌氧氨氧化细菌

宋亚娜 林智敏 陈在杰 刘晓强

宋亚娜, 林智敏, 陈在杰, 刘晓强. 荧光定量PCR技术检测红壤稻田土壤厌氧氨氧化细菌[J]. 福建农业学报, 2010, 25(1): 82-85.
引用本文: 宋亚娜, 林智敏, 陈在杰, 刘晓强. 荧光定量PCR技术检测红壤稻田土壤厌氧氨氧化细菌[J]. 福建农业学报, 2010, 25(1): 82-85.
SONG Ya-na, LIN Zhi-min, CHEN Zai-jie, LIU Xiao-qiang. Real-time PCR quantification of anaerobic ammonia-oxidizing microorganisms in red paddy soil[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2010, 25(1): 82-85.
Citation: SONG Ya-na, LIN Zhi-min, CHEN Zai-jie, LIU Xiao-qiang. Real-time PCR quantification of anaerobic ammonia-oxidizing microorganisms in red paddy soil[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2010, 25(1): 82-85.

荧光定量PCR技术检测红壤稻田土壤厌氧氨氧化细菌

基金项目: 

福建省科技项目-公益类科研究所基本科研专项(2009R10035-9);福建省科技计划重点项目(2008N0110)

详细信息
  • 中图分类号: S154.3

Real-time PCR quantification of anaerobic ammonia-oxidizing microorganisms in red paddy soil

  • 摘要: 利用厌氧氨氧化细菌16S rDNA基因特异引物对红壤稻田土壤总DNA 进行扩增、PCR产物纯化、克隆和测序,得到属浮霉菌(Planctomycetes)的厌氧氨氧化细菌的部分16S rDNA序列(长度为502 bp).以含该序列的重组质粒作为荧光定量PCR的标准品,对水稻不同生育期红壤稻田土壤中的厌氧氨氧化细菌数量进行检测.结果表明水稻各生育期内稻田表层和根层土壤中均存在一定数量的厌氧氨氧化细菌,且其数量随水稻生长有所变化.表土中的数量随水稻生长呈逐渐增加的趋势,根层土的数量在水稻生长前期变化不大,孕穗期后明显增加.红壤稻田土壤中存在的厌氧氨氧化细菌对稻田土壤的硝化作用可能具有一定贡献.
  • [1] DRAAF A A,MULDER A,PETER DE B,et al.Anaerobic oxidation of ammonium is a biologically mediated process[J].Appl Environ Microbiol,1955,61(4):1246-1251.
    [2] 任宏洋,张代钧,丛丽影,等.一种未见报道的厌氧氨氧化细菌分子生物学鉴定[J].环境工程学报,2008,2 (3):314-318.
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出版历程
  • 收稿日期:  2009-11-20
  • 修回日期:  2010-01-05
  • 刊出日期:  2010-02-15

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