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米曲霉6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(gnd)的克隆及生物信息学分析

吴晶晶 洪志宏 张卡 陈宏文

吴晶晶, 洪志宏, 张卡, 陈宏文. 米曲霉6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(gnd)的克隆及生物信息学分析[J]. 福建农业学报, 2012, 27(4): 394-399.
引用本文: 吴晶晶, 洪志宏, 张卡, 陈宏文. 米曲霉6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(gnd)的克隆及生物信息学分析[J]. 福建农业学报, 2012, 27(4): 394-399.
WU Jing-jing, HONG Zhi-hong, ZHANG Ka, CHEN Hong-wen. Cloning and Bioinformatic Analysis of 6-Phogluconate Dehydrogenase Gene from Aspergillus oryzae[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2012, 27(4): 394-399.
Citation: WU Jing-jing, HONG Zhi-hong, ZHANG Ka, CHEN Hong-wen. Cloning and Bioinformatic Analysis of 6-Phogluconate Dehydrogenase Gene from Aspergillus oryzae[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2012, 27(4): 394-399.

米曲霉6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(gnd)的克隆及生物信息学分析

基金项目: 

教育部留学回国人员科研启动基金(2010);福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划(07FJRCO3);中央高校基本科研业务费专项资金(JB-ZR1112)

详细信息
    通讯作者:

    陈宏文(1969-),女,副教授,研究方向:生物工程、基因工程(E-mail:chenhw@hqu.edu.cn)

  • 中图分类号: S 852

Cloning and Bioinformatic Analysis of 6-Phogluconate Dehydrogenase Gene from Aspergillus oryzae

  • 摘要: 采用PCR技术从米曲霉CICC2012菌株基因组中克隆6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因(gnd),并利用生物信息学手段对其氨基酸序列、进化树、理化性质、蛋白质结构等进行分析。序列测定和分析结果表明,gnd基因序列长为1 723 bp,包含1个1 551 bp的开放阅读框,编码516个氨基酸;gnd基因编码的6PGDH氨基酸序列与黄曲霉6PGDH基因的同源性为99%,存在的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点分别有11、2和6个;6PGDH蛋白分子量为57.3 kD,等电点为5.63;gnd基因编码蛋白二级结构α-螺旋区域占44.57%,β-折叠区域占12.79%,无规则卷曲区域占42.64%;氨基酸残基11~195位点为NADP+结合区域。
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出版历程
  • 收稿日期:  2012-04-05
  • 修回日期:  2012-04-16
  • 刊出日期:  2012-04-30

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