• 中文核心期刊
  • CSCD来源期刊
  • 中国科技核心期刊
  • CA、CABI、ZR收录期刊

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

4种不同土壤微生物DNA提取方法对DGGE分析微生物群落的影响

吕新 陈丽华 李玥仁

吕新, 陈丽华, 李玥仁. 4种不同土壤微生物DNA提取方法对DGGE分析微生物群落的影响[J]. 福建农业学报, 2012, 27(4): 367-372.
引用本文: 吕新, 陈丽华, 李玥仁. 4种不同土壤微生物DNA提取方法对DGGE分析微生物群落的影响[J]. 福建农业学报, 2012, 27(4): 367-372.
LV Xin, CHEN Li-hua, LI Yue-ren. Effect of DNA Extraction on DGGE Analysis of Microbial Community in Soil[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2012, 27(4): 367-372.
Citation: LV Xin, CHEN Li-hua, LI Yue-ren. Effect of DNA Extraction on DGGE Analysis of Microbial Community in Soil[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2012, 27(4): 367-372.

4种不同土壤微生物DNA提取方法对DGGE分析微生物群落的影响

基金项目: 

农业部转基因生物新品种培育科技重大专项(2009ZX08011-029B)

详细信息
    通讯作者:

    李玥仁(1966-),男,研究员,博士,主要从事生物多样性研究(E-mail:yuerenli@yahoo.com.cn)

  • 中图分类号: S 154.36

Effect of DNA Extraction on DGGE Analysis of Microbial Community in Soil

  • 摘要: 分别应用高盐法、玻璃珠破碎法、冻融法和试剂盒法4种不同土壤微生物DNA提取方法提取水稻稻田土壤微生物DNA,并通过细菌16S rRNA V3区通用引物GC338f-530R和真菌18S rRNA特异性引物NS1-GCFung进行PCR扩增结合变性梯度凝胶电泳(CGGE)分析,对4种DNA提取方法进行评价。结果表明,玻璃珠破碎法和试剂盒法提取的DNA均能满足土壤微生物多样性分析的要求;其中试剂盒方法操作简单,提取的DNA 质量较高,但DNA 产量较低且成本昂贵;玻璃珠破碎法用时较长,步骤繁琐,DNA产量较高,纯度较低,但对后续PCR扩增和DGGE分析没有明显影响,且成本低廉。
  • [1] OGRAM A, SAYLER G S, BARKAY T. The extraction and purification of microbial DNA from sediments[J]. Journal of microbiological methods,1987, 7(2-3): 57-66.
    [2] BOURRAIN M, ACHOUAK W, URBAIN V, et al. DNA extraction from activated sludges[J]. Current microbiology,1999, 38(6): 315-319.
    [3] ZHOU J, BRUNS M A, TIEDJE J M. DNA recovery from soils of diverse composition[J]. Appl Environ Microbiol,1996, 62(2): 316-322.
  • 加载中
计量
  • 文章访问数:  3249
  • HTML全文浏览量:  121
  • PDF下载量:  557
  • 被引次数: 0
出版历程
  • 收稿日期:  2012-03-23
  • 修回日期:  2012-04-15
  • 刊出日期:  2012-04-30

目录

    /

    返回文章
    返回