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微生物发酵床垫料微生物总DNA提取方法的研究

刘云浩 蓝江林 刘波 朱昌雄 郭萍 陈燕萍

刘云浩, 蓝江林, 刘波, 朱昌雄, 郭萍, 陈燕萍. 微生物发酵床垫料微生物总DNA提取方法的研究[J]. 福建农业学报, 2011, 26(2): 153-158.
引用本文: 刘云浩, 蓝江林, 刘波, 朱昌雄, 郭萍, 陈燕萍. 微生物发酵床垫料微生物总DNA提取方法的研究[J]. 福建农业学报, 2011, 26(2): 153-158.
LIU Yun-hao, LAN Jiang-lin, LIU Bo, ZHU Chang-xiong, CHEN Yan-ping, . Extraction Methods for Bedding Microbial DNA from Fermentation Bed[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2011, 26(2): 153-158.
Citation: LIU Yun-hao, LAN Jiang-lin, LIU Bo, ZHU Chang-xiong, CHEN Yan-ping, . Extraction Methods for Bedding Microbial DNA from Fermentation Bed[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2011, 26(2): 153-158.

微生物发酵床垫料微生物总DNA提取方法的研究

基金项目: 

国家水体污染控制与治理科技重大专项(2008ZX07425-002);国家科技支撑计划项目(2008BAD96B07、2009BADC2B02);福建省发改委项目(闽发改投资[2008]762号);福建省科技计划省属公益类科研院所基本科研专项(2010R1020-1)

详细信息
    通讯作者:

    刘波(1957-),研究员,博士,博导,研究方向:微生物生物技术与农业生物药物(E-mail:liubofz@163.com);朱昌雄(1963-),研究员,博导,研究方向:微生物与环境修复(E-mail:zhucx120@163.com)

    刘波(1957-),研究员,博士,博导,研究方向:微生物生物技术与农业生物药物(E-mail:liubofz@163.com);朱昌雄(1963-),研究员,博导,研究方向:微生物与环境修复(E-mail:zhucx120@163.com)

  • 中图分类号: Q781

Extraction Methods for Bedding Microbial DNA from Fermentation Bed

  • 摘要: 传统的平板分离培养法,不能全面反映垫料微生物的基因信息,所以获得高质量的垫料微生物总DNA对于研究垫料微生物的群落结构就显得尤为重要。本实验设计对比了6种关于养猪发酵床垫料微生物总DNA的提取方法,对6种方法提取的DNA的浓度和纯度进行比较评价,结果表明,试剂盒法中因为没有专门针对本实验垫料的总DNA提取试剂盒,所采用的粪便,土壤以及淤泥总DNA提取试剂盒都没有达到很好的效果;而在化学法当中,单纯的SDS法和CTAB法都不能有效除去腐殖酸和杂蛋白的污染,通过核酸蛋白分析仪测定的A260/A280的比值基本都在1.5以下,说明纯度很低,用16S rDNA通用引物进行PCR扩增也没有得到目的条带。在SDS-CTAB结合法中利用10%的PEG-8000进行沉淀不进行回收纯化所提取的DNA具有完整性好,纯度高的优点,浓度达到200 ngL-1以上,通过核酸蛋白分析仪测定的A260/A280的比值达到1.8左右。用16S rDNA通用引物扩增得到比较亮的目的条带,因此SDS-CTAB结合法是一种高效、可靠的垫料微生物总DNA提取方法,有利于进行下游的分子生态学研究。
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    [3] 易庆平,罗正荣,张青林,等,植物总基因组DNA提取纯化方法综述[J].安徽农业科学,2007,35(25):7789-7791.
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出版历程
  • 收稿日期:  2011-03-03
  • 修回日期:  2011-03-24
  • 刊出日期:  2011-04-15

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